科學(xué)家已經(jīng)在人體組織和胎盤中檢測到微塑料。 圖片來源:Rungroj Yongrit/EPA
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紙質(zhì)吸管取代塑料吸管,環(huán)保餐具取代普通塑料餐具,可降解塑料袋取代一次性塑料袋……今年1月起,新版限塑令將正式生效,許多一次性塑料制品的生產(chǎn)、銷售和使用被按下了停止鍵。
盡管我國對塑料制品的限制使用和回收再利用日益重視,但仍有大量塑料被直接釋放到環(huán)境中?!斑@些暴露的塑料制品在物理作用、光降解等過程影響下形成微塑料,最終進(jìn)入生態(tài)圈和食物鏈,為整個(gè)生態(tài)系統(tǒng)帶來潛在影響。”1月27日,中科院微生物所研究員吳邊在接受《中國科學(xué)報(bào)》采訪時(shí)說。
在此背景下,吳邊團(tuán)隊(duì)與國內(nèi)外合作者基于計(jì)算機(jī)蛋白質(zhì)設(shè)計(jì),實(shí)現(xiàn)了高濃度聚對苯二甲酸乙二酯(PET)微塑料在溫和條件下的完全降解,為廢水中微塑料的預(yù)處理提供新的處理思路。相關(guān)成果近日以封面論文形式發(fā)表于美國化學(xué)會(huì)旗下的《催化》期刊。
從“白色污染”到“隱形殺手”
自上世紀(jì)初誕生以來,塑料工業(yè)已成為科技“雙刃劍”效應(yīng)的典型產(chǎn)業(yè)之一。它在給人類生活、生產(chǎn)帶來方便的同時(shí),也導(dǎo)致大量的廢舊塑料垃圾不斷產(chǎn)生。
“由于其固有的硬度、強(qiáng)度、耐用性及穩(wěn)定性需求,廢棄塑料制品無法自動(dòng)降解,對環(huán)境造成嚴(yán)重危害。”論文共同第一作者、微生物所助理研究員崔穎璐對《中國科學(xué)報(bào)》說。目前,塑料垃圾的處理方式通常是填埋和焚燒,這種“生產(chǎn)—廢棄—處理”的單向過程既不符合循環(huán)經(jīng)濟(jì)的理念,也無法從源頭解決“白色污染”問題。
相比于能夠回收的塑料,肉眼看不見的微塑料的威脅更為嚴(yán)重,情況更為緊迫。
在2004年發(fā)表于《科學(xué)》雜志的文章中,英國普利茅斯大學(xué)的理查德·湯普森(Richard C. Thompson)等首次提出“微塑料”的概念。大量不可降解的微小塑料碎片(直徑約20微米)在環(huán)境中逐步轉(zhuǎn)移到土壤和海洋,最終進(jìn)入生態(tài)圈和食物鏈,被包括人類在內(nèi)的生物攝入,威脅人類健康和動(dòng)植物的生存。
近十余年來,國內(nèi)外大量研究先后發(fā)現(xiàn),微塑料可被農(nóng)作物、(魚類、蚯蚓、雞、蜜蜂等海洋和陸地)動(dòng)物和人類吸收,影響其生長、發(fā)育和繁殖能力。去年,意大利一項(xiàng)研究首次報(bào)告在人類胎盤組織可檢測出微塑料,并證實(shí)這些微塑料攜帶對人類健康可產(chǎn)生長期影響的內(nèi)分泌破壞物質(zhì)。
“雖然在動(dòng)物研究中發(fā)現(xiàn),塑料濃度最高的地方是腸道,但最小的塑料微粒能夠進(jìn)入血液、淋巴系統(tǒng),甚至可能到達(dá)肝臟?!眾W地利維也納醫(yī)科大學(xué)研究員Philipp Schwabl曾表示。英國倫敦國王學(xué)院的Frank Carey也表示,當(dāng)微塑料濃度足夠大的時(shí)候,這些化學(xué)物質(zhì)能傷害甚至殺死細(xì)胞,蛋白質(zhì)及DNA都可能受到傷害。
在此背景下,2020年1月我國發(fā)布的《關(guān)于進(jìn)一步加強(qiáng)塑料污染治理的意見》提出了分2020年、2022年、2025年三個(gè)時(shí)間段,加強(qiáng)塑料污染治理分階段的任務(wù)目標(biāo)。同時(shí)也對各類塑料制品制定了具體的禁止、限制生產(chǎn)或使用要求,包括塑料袋、塑料餐具、酒店等場所的一次性塑料用品和快遞塑料包裝。
盡管我國已在限制塑料制品的使用,并鼓勵(lì)回收再利用,但當(dāng)前仍有許多塑料被直接釋放到環(huán)境中。公開數(shù)據(jù)顯示,2019年,我國塑料制品累計(jì)產(chǎn)量8184萬噸,塑料薄膜產(chǎn)量達(dá)1594.62萬噸。相比之下,2019年生物降解塑料消費(fèi)量僅為52萬噸。在限塑令逐步實(shí)施的過程中,發(fā)展綠色生物降解策略成為生態(tài)環(huán)境保護(hù)的迫切需求。
打造“殺手”之“克星”
“是否可以無需經(jīng)過回收處理,就能就地降解微塑料呢?”長期從事人工設(shè)計(jì)酶蛋白的吳邊希望能夠通過人工智能(AI),提供“更綠色”的解決方案。
目前,溫和條件下的微塑料原位降解研究是一個(gè)新興領(lǐng)域。即利用原有或接種微生物降解或代謝微塑料,將其轉(zhuǎn)化為無害的末端產(chǎn)品過程。在此過程中加入催化物可用于加強(qiáng)生物降解。“生物催化本身具有天然的綠色性,理想的生物酶可讓微塑料降解事半功倍?!眳沁呎f。
2016年,日本京都工藝?yán)w維大學(xué)的Kohei Oda團(tuán)隊(duì)報(bào)道了首個(gè)可在30℃下有效降解低結(jié)晶度PET塑料(自然降解時(shí)間需要數(shù)百年)的IsPETase降解酶。然而,該酶穩(wěn)定性極差,并不能滿足生物降解實(shí)際應(yīng)用需求。
在此背景下,吳邊團(tuán)隊(duì)與微生物所向華團(tuán)隊(duì)及天津工業(yè)生物技術(shù)研究所、中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)、南京大學(xué)以及美國加州大學(xué)的研究者合作,探究是否可以通過原位處理,就地降解微塑料。他們提出了一種提出新型蛋白質(zhì)穩(wěn)定性計(jì)算設(shè)計(jì)策略(GRAPE),基于計(jì)算機(jī)蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)對IsPETase進(jìn)行了穩(wěn)定性改造,獲得了適應(yīng)性顯著增強(qiáng)的重設(shè)計(jì)酶(DuraPETase)。
因其在將PET轉(zhuǎn)化為碳和能源方面的潛力,自2016年發(fā)現(xiàn)以來,全球有許多科研團(tuán)隊(duì)對其進(jìn)行了改造。“據(jù)我所知,DuraPETase是迄今為止開發(fā)的最好的PETase突變體?!睂徃迦嗽u論稱。
新設(shè)計(jì)的酶蛋白“消化”塑料的能力遠(yuǎn)超自然界中發(fā)現(xiàn)的物質(zhì)。在溫和條件下,DuraPETase對30%結(jié)晶度PET薄膜的降解效率相較于野生型提升了300倍。通過掃描電鏡可觀察到,經(jīng)其處理后的PET薄膜內(nèi)部結(jié)構(gòu)發(fā)生了顯著的腐蝕變化——實(shí)現(xiàn)了2克/升的高濃度微塑料在溫和條件下的完全降解。
“這里的溫和條件指的是工程微生物的最適溫度37℃,在這個(gè)條件下,我們期望可以在未來通過微生物技術(shù)來降解微塑料,為廢水中微塑料的預(yù)處理提供新的處理思路?!眳沁呎f。
AI加持 效率更高
酶蛋白可謂現(xiàn)代生物催化反應(yīng)的“芯片”。若用理想的生物酶為“媒”,生物催化可事半功倍。此次研究中,DuraPETase生物酶的誕生是人工智能(AI)設(shè)計(jì)蛋白在實(shí)際應(yīng)用中的又一次突破。
“目前,酶穩(wěn)定性計(jì)算改造的主要瓶頸問題是無法解決有益突變的全局疊加問題?!眳沁呎f。以往以蛋白質(zhì)進(jìn)化手段獲取高性能酶是一個(gè)漫長的過程。新研究結(jié)合了蛋白質(zhì)理性設(shè)計(jì)和AI算法,對計(jì)算獲得的有益突變體進(jìn)行系統(tǒng)聚類分析,再結(jié)合貪婪算法進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)迭代疊加,大幅規(guī)避了負(fù)協(xié)同相互作用,在較短時(shí)間內(nèi)最大限度的探索出疊加路徑。
DuraPETase的晶體結(jié)構(gòu) 圖片來源:崔穎璐等
“這就好比在一個(gè)團(tuán)隊(duì)中,我們有很多優(yōu)秀的人才,各司其職,但我們并不確定哪些人在一起合作可以發(fā)揮最大的效果。GRAPE策略就是來解決這個(gè)問題,它通過對人才進(jìn)行歸類,并迭代組成不同的小團(tuán)體,可以快速地找出最適合在一起合作的團(tuán)隊(duì)?!贝薹f璐解釋說。
對此,審稿人認(rèn)為,這在很大程度上提高了PET降解酶在高溫條件下的穩(wěn)定性和效率。研究進(jìn)一步表明,這種酶在環(huán)境溫度下也有顯著改善的性能,并對PBT和PEN等其他聚酯塑料底物也有降解作用。
下一步,研究者希望把DuraPETase酶蛋白整合到微生物,甚至工程微生物組中,實(shí)現(xiàn)環(huán)境中的直接降解。例如,可在一些垃圾回收場旁邊設(shè)立降解場地,直接在降解場地投放微生物實(shí)現(xiàn)降解?!爱?dāng)然,這只是目前的一個(gè)設(shè)想。微塑料里面包含的塑料種類較多,目前我們主要涉及到PET塑料的處理,所以還嚴(yán)重依賴前期的回收分類環(huán)節(jié)?!贝薹f璐說。
目前,研究作者已公布了新生物酶的全部序列信息,且未申請專利?!八芰辖到馐且豁?xiàng)全球公益性事件,我們希望提供一個(gè)針對微塑料原位生物降解的有價(jià)值的工具,為以后的研究提供一個(gè)高性能的蛋白模板,期待更多的研究者可以在這個(gè)酶基礎(chǔ)上進(jìn)行后續(xù)的改造?!眳沁呎f。
相關(guān)文章鏈接:
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscatal.0c05126
https://doi.org/10.1038/s41893-020-0567-9
https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2020.123828
https://doi.org/10.1016/j.envint.2020.106274
該研究得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金委員會(huì)與歐盟委員會(huì)環(huán)境生物技術(shù)合作研究項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年項(xiàng)目和面上項(xiàng)目、中國科學(xué)院戰(zhàn)略生物資源服務(wù)網(wǎng)絡(luò)計(jì)劃生物資源衍生庫項(xiàng)目、以及北京市自然科學(xué)基金項(xiàng)目的支持,并獲得了諾維信公司的大力支持和幫助。
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