(圖片來源:CC0 Public Domain)
RNA介導(dǎo)的染色質(zhì)調(diào)控對于許多組織中的基因表達(dá)十分關(guān)鍵。但目前尚不清楚RNA是如何調(diào)控染色質(zhì)DNA的包裝,從而控制基因的表達(dá)開關(guān)。
然而,來自Caroline Dean教授實驗室Xiaofeng Fang博士的一篇新論文展示了塑造染色質(zhì)的蛋白和RNA處理機(jī)制之間相互作用的過程。由此確立了反義RNA處理如何影響染色質(zhì)狀態(tài),以及定量調(diào)控擬南芥FLC位點的表達(dá)。
該研究小組使用了一種名為交聯(lián)核免疫沉淀和質(zhì)譜(CLNIP–MS)的手段。這種方法由John Innes Center蛋白質(zhì)組學(xué)團(tuán)隊的專家開發(fā)。他們利用甲醛來捕捉植物中蛋白質(zhì)的相互作用,否則這種相互作用會由于作用時間短而無法捕捉。
在論文中,研究人員揭示了反義RNA COOLAIR如何結(jié)合3' RNA進(jìn)行RNA加工的因子。他們展示了3'RNA加工因子和改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)的蛋白FLD/LD/SD626動態(tài)結(jié)合的過程,這個復(fù)合體從而阻止了基因的表達(dá)。
該研究的主要作者Xiaofeng Feng博士解釋道:“這項工作對于了解RNA介導(dǎo)的染色質(zhì)沉默是十分關(guān)鍵的。我們已經(jīng)可以機(jī)械地將RNA加工因子和染色質(zhì)修飾因子結(jié)合起來?!?/p>
這些新闡明的物理相互作用導(dǎo)致染色質(zhì)的改變,從而關(guān)閉FLC——一個調(diào)節(jié)開花的關(guān)鍵基因的表達(dá)。如果3'加工因子或染色質(zhì)修飾因子被移除,這個基因又會重新表達(dá)。
有趣的是,這一過程和酵母中基因調(diào)控的方式類似,盡管確切的等效機(jī)制在酵母中尚不清楚。表觀遺傳機(jī)制的保守性意味著這項工作與了解所有生物體中基因表達(dá)的開關(guān)有關(guān)。
翻譯:唐儆
審校:巢栩嘉
引進(jìn)來源:約翰英納斯中心(John Innes Centre)
引進(jìn)鏈接:https://phys.org/news/2020-06-physical-link-rna-epigenetic-silencing.html
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