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從20世紀(jì)70年代開(kāi)始，云南省怒江州就開(kāi)始種植草果，到2020年，種植面積已達(dá)111萬(wàn)畝，不僅是全國(guó)草果的核心產(chǎn)區(qū)，也是當(dāng)?shù)厝罕娒撠氈赂坏闹匾?jīng)濟(jì)作物。
為了加快提高草果遺傳改良效率，培育高產(chǎn)、抗病、優(yōu)質(zhì)、安全新品種，對(duì)從源頭創(chuàng)新保障草果產(chǎn)業(yè)健康可持續(xù)發(fā)展，2019年9月，怒江州聯(lián)合華南農(nóng)業(yè)大學(xué)等國(guó)內(nèi)外高?？蒲性核鶛C(jī)構(gòu)，正式啟動(dòng)草果全基因組測(cè)序計(jì)劃，歷時(shí)1年零3個(gè)月，成功完成草果全基因組測(cè)序工作，繪制了精細(xì)圖譜，并于1月13日正式對(duì)外發(fā)布。
通過(guò)Nanopore及illumina等測(cè)序技術(shù)，拼接組裝得到2.08G大小的基因組，組裝出由1145個(gè)contig序列組成的草果參考基因組序列，GC含量為40.9%，最長(zhǎng)的contig長(zhǎng)度為31.6Mb，N50為4.7Mb。結(jié)合HiC測(cè)序結(jié)果，得到24對(duì)染色體的高質(zhì)量基因組，包括42394個(gè)基因。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組、代謝組關(guān)聯(lián)分析，得到草果關(guān)鍵香氣物質(zhì)合成的候選基因一批。草果全基因組精細(xì)圖譜完成將極大推動(dòng)草果的全基因組精準(zhǔn)育種，為打造國(guó)家級(jí)草果種質(zhì)資源圃提供重要基礎(chǔ)作用。（總臺(tái)央視記者 劉文杰）
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