?近年來(lái)GPB的中國(guó)風(fēng)封面 馮麗妃攝
從編委到現(xiàn)任執(zhí)行副主編,美國(guó)費(fèi)城兒童醫(yī)院和賓夕法尼亞大學(xué)教授邢毅與《基因組蛋白質(zhì)組與生物信息學(xué)報(bào)》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics,以下簡(jiǎn)稱GPB)期刊結(jié)緣已近10年。前些年,該刊編輯部不時(shí)找他約稿子,以解“缺米之炊”?!艾F(xiàn)在我們也會(huì)找人約稿,但跟以前已經(jīng)完全不一樣了?!毙弦銓?duì)《中國(guó)科學(xué)報(bào)》說(shuō)。
從2003年創(chuàng)刊至今,GPB一路“過(guò)關(guān)斬將”,先后從季刊變?yōu)殡p月刊,加入開放獲取行列,終于被科學(xué)引文索引擴(kuò)展版(SCIE)收錄,并連續(xù)3年位于“遺傳學(xué)與遺傳性”學(xué)科領(lǐng)域前10%。在此過(guò)程中,它吸引的國(guó)內(nèi)外投稿數(shù)量逐年遞增,如今錄用率低于10%。
“我對(duì)這本期刊專業(yè)化的稿件處理印象深刻。該刊由領(lǐng)域內(nèi)一群富有熱情的、杰出的科研工作者運(yùn)行,在組學(xué)和生物信息學(xué)研究領(lǐng)域的出版獲得了國(guó)際認(rèn)可?!?諾貝爾獎(jiǎng)得主、擔(dān)任GPB編委的托馬斯·林達(dá)爾(Tomas Lindahl)曾如此評(píng)價(jià)。
在GPB創(chuàng)刊人兼主編、中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所(國(guó)家生物信息中心)(以下簡(jiǎn)稱基因組所)研究員于軍看來(lái),如果沒(méi)有始終如一的堅(jiān)持,這個(gè)期刊就不會(huì)有今天的局面,甚至可能難以生存下來(lái)?!拔覀儽仨氼^腦清醒,GPB始終面對(duì)與全球不斷擴(kuò)張的雜志競(jìng)爭(zhēng)創(chuàng)新性研究成果。我們要堅(jiān)守住自己的領(lǐng)域,要贏過(guò)競(jìng)爭(zhēng)者,就必須實(shí)實(shí)在在地把好質(zhì)量關(guān)?!彼f(shuō)。
聚焦“三國(guó)”創(chuàng)新刊
21世紀(jì)之交,在人類基因組計(jì)劃的帶動(dòng)下,全球風(fēng)靡基因組測(cè)序。借著這股“東風(fēng)”,GPB誕生了。
這并不容易。創(chuàng)建一本期刊,從學(xué)科發(fā)展到基礎(chǔ)支撐再到人才的到位,“天時(shí)、地利、人和”缺一不可。
上世紀(jì)90年代啟動(dòng)的人類基因組計(jì)劃是生物技術(shù)發(fā)展的里程碑,也為我國(guó)基因組學(xué)的發(fā)展和人才的集聚提供了前所未有的機(jī)遇。1998年,于軍和楊煥明、汪建等科學(xué)家抓住這一機(jī)遇窗口,回國(guó)加盟中國(guó)科學(xué)院遺傳研究所,創(chuàng)建了人類基因組研究中心,并承擔(dān)了人類基因組計(jì)劃1%的測(cè)序任務(wù),使我國(guó)成為唯一一個(gè)參與該計(jì)劃的發(fā)展中國(guó)家。
2003年,歷時(shí)13年、耗資近10億美元的人類基因組計(jì)劃宣告完成,它開啟了諸多前所未有的新學(xué)科分支(基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、生物信息學(xué)等)。同年,基于人類基因組研究中心組建的基因組所籌備成立。這為GPB的落地提供了科學(xué)和現(xiàn)實(shí)的土壤。
這一時(shí)期,在中國(guó)科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程的背景下,原中國(guó)科學(xué)院發(fā)育生物學(xué)研究所經(jīng)合并成為今天中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所的一部分。依托原發(fā)育生物學(xué)所的《發(fā)育與生殖生物學(xué)報(bào)》經(jīng)過(guò)變更,主辦單位改為基因組所和中國(guó)遺傳學(xué)會(huì),報(bào)道內(nèi)容轉(zhuǎn)而聚焦基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)三個(gè)方向。由此,GPB應(yīng)運(yùn)而生。
“GPB最重要的目標(biāo)是促進(jìn)基因組信息轉(zhuǎn)化為生物學(xué)知識(shí),這是一個(gè)讓科學(xué)發(fā)現(xiàn)被科學(xué)家和公眾理解和接受的過(guò)程。我們希望這本期刊提供一個(gè)促進(jìn)這一進(jìn)程的工具?!痹趧?chuàng)刊社論“‘三國(guó)’演義”中,于軍等人這樣寫道。
正如他們所期待的那樣,這個(gè)聚焦生物學(xué)三個(gè)“小王國(guó)”的期刊吸引了包括諾貝爾獎(jiǎng)得主、院士、業(yè)內(nèi)先鋒人物在內(nèi)的領(lǐng)域“大咖”投稿或擔(dān)任編委,成為推進(jìn)我國(guó)相關(guān)領(lǐng)域內(nèi)國(guó)際學(xué)術(shù)交流的重要平臺(tái)。從2003年應(yīng)對(duì)非典型肺炎到2020年迅速對(duì)新冠肺炎做出反應(yīng),它記錄和反映了中國(guó)生物技術(shù)研究的成長(zhǎng)歷程。
它還見(jiàn)證了近20年來(lái)“基因組時(shí)代”的大踏步前進(jìn)。從單堿基到單細(xì)胞、單分子,基因測(cè)序技術(shù)呈跳躍式發(fā)展;從代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)到免疫組學(xué)、RNA組學(xué)……生命科學(xué)的“組學(xué)”邊界不斷拓展;對(duì)個(gè)人基因組測(cè)序如何能夠提高醫(yī)療服務(wù)的輪廓也變得越來(lái)越清晰,基因組學(xué)的發(fā)展進(jìn)入精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代。
如今,基因組學(xué)的發(fā)展仍在向新的方向“演義”。在于軍看來(lái),人類基因組計(jì)劃衍生出的日益增加的各類組學(xué)正應(yīng)了“合久必分,分久必合”的“天下大勢(shì)”?!霸诖吮尘跋拢珿PB大有可為。”他說(shuō)。
專業(yè)人辦專業(yè)刊
過(guò)去十年,GPB經(jīng)歷了脫胎換骨式的迅猛生長(zhǎng)。在主辦單位的大力支持下,期刊轉(zhuǎn)變運(yùn)行模式, 抓住兩個(gè)關(guān)鍵:科學(xué)家辦刊和職業(yè)化的編輯隊(duì)伍。
“專家辦刊,各做所長(zhǎng),這是GPB的一個(gè)特點(diǎn)。”該刊副主編、基因組所研究員楊運(yùn)桂對(duì)《中國(guó)科學(xué)報(bào)》說(shuō),其優(yōu)勢(shì)之一是專家了解領(lǐng)域動(dòng)態(tài),能夠?yàn)槠诳x擇適合的約稿對(duì)象。
2008年,楊運(yùn)桂受邀擔(dān)任GPB編委,他一邊邀請(qǐng)國(guó)內(nèi)外領(lǐng)域內(nèi)的大家加入期刊編委會(huì),一邊積極向認(rèn)識(shí)的科學(xué)家約稿。2013年,為慶祝創(chuàng)刊10周年,楊運(yùn)桂邀請(qǐng)導(dǎo)師托馬斯·林達(dá)爾在GPB發(fā)表了“通向DNA修復(fù)之路”一文。2015年,在林達(dá)爾獲得諾貝爾獎(jiǎng)之際,這篇文章得到了大量轉(zhuǎn)載。
“對(duì)于一本新刊來(lái)說(shuō),真正能提升影響力的還是約稿。比如邀請(qǐng)專業(yè)人士對(duì)一個(gè)新領(lǐng)域進(jìn)行綜述?!毙弦阏f(shuō)。2014年,三代測(cè)序的興起引起關(guān)注,他邀請(qǐng)當(dāng)時(shí)在愛(ài)荷華大學(xué)工作的區(qū)健輝撰寫了綜述文章“PacBio測(cè)序及其應(yīng)用”。目前該文在國(guó)際引文數(shù)據(jù)庫(kù)Web of Science中的引用量超600次,是基本科學(xué)指標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)(ESI)高被引論文之一。
“我們的一個(gè)強(qiáng)項(xiàng)是不僅認(rèn)識(shí)領(lǐng)域內(nèi)的所有中國(guó)專家,也認(rèn)識(shí)為數(shù)眾多的國(guó)外專家,并且非常熟悉他們的學(xué)科傳承和工作進(jìn)展。只有深耕沃土,方得壯苗碩果。”于軍說(shuō)。GPB目前有12名副主編、83名編委,其中包括諾貝爾獎(jiǎng)獲得者、院士及多位ESI高引作者。正是立足于這樣一個(gè)龐大的科學(xué)家隊(duì)伍,近年來(lái)GPB的優(yōu)秀文章不斷增加。
2011年,焦玉霞的加盟讓這本期刊的職業(yè)編輯隊(duì)伍穩(wěn)定下來(lái)。在此之前,該刊編輯部只有“一個(gè)半人”:一人全職但人員不穩(wěn)定,還有“半個(gè)人”是兼職?!斑@種情況很難實(shí)現(xiàn)期刊編輯隊(duì)伍的專業(yè)化。”于軍說(shuō)。
加入GPB后,焦玉霞成了這本期刊的職業(yè)“經(jīng)紀(jì)人”,從約稿、初審到各類會(huì)議、專輯組織、宣傳和協(xié)調(diào),多方位推進(jìn)提升期刊的質(zhì)量和顯示度。她到崗后的第一件事就是招聘編輯,逐漸形成如今3個(gè)人的穩(wěn)定團(tuán)隊(duì)。她本人也于2013年獲得中科院期刊出版領(lǐng)域引進(jìn)優(yōu)秀人才擇優(yōu)支持。
編輯隊(duì)伍的穩(wěn)定和專業(yè)化的辦刊模式讓期刊發(fā)展進(jìn)入快車道——
2012年, 期刊采用國(guó)際出版商愛(ài)思唯爾的后期生產(chǎn)流程,實(shí)現(xiàn)單篇文章的網(wǎng)上預(yù)發(fā)表。
2013年,期刊試水開放獲?。∣A)出版。“OA使得期刊的下載量翻倍增長(zhǎng),其中一半以上來(lái)自非訂閱用戶?!苯褂裣几嬖V《中國(guó)科學(xué)報(bào)》。同年,剛過(guò)完10周歲生日的GPB迎來(lái)一份影響深遠(yuǎn)的生日禮物:“中國(guó)科技期刊國(guó)際影響力提升計(jì)劃”的擇優(yōu)資助, 這讓期刊的發(fā)展如虎添翼。
2017年,經(jīng)國(guó)內(nèi)外專家的推薦,該刊被SCIE收錄。
2018年,該刊獲得首個(gè)影響因子(IF,6.615)。
2019年,它受到科技部等七部門聯(lián)合實(shí)施的“中國(guó)科技期刊卓越行動(dòng)計(jì)劃”資助(2019-2023)。
2020年,其影響因子達(dá)到7.051,連續(xù)3年位于“遺傳學(xué)與遺傳性”學(xué)科領(lǐng)域前10%。
“這兩年,我們的原創(chuàng)文章比例明顯在增加,綜述類文章的比例在下降,但我們的影響因子仍然比較穩(wěn)定,這說(shuō)明我們?cè)瓌?chuàng)文章的質(zhì)量在改善?!睏钸\(yùn)桂說(shuō)。
“毫無(wú)疑問(wèn),過(guò)去十年編委會(huì)和編輯部成員的積極參與和支持對(duì)GPB的成長(zhǎng)至關(guān)重要?!庇谲娬f(shuō),“這樣的國(guó)際編委團(tuán)隊(duì)和嚴(yán)謹(jǐn)工作讓我們的稿件質(zhì)量達(dá)到了國(guó)際水平?!?/p>
培育“特色”促發(fā)展
近20年的摸索,也讓GPB逐漸形成一系列的特色。
近幾年GPB的一個(gè)重要的發(fā)展點(diǎn)是服務(wù)我國(guó)組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)?;蚪M時(shí)代的一個(gè)特征是海量數(shù)據(jù)的生成。2005年,美國(guó)、歐洲和日本建立了國(guó)際核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)聯(lián)盟(INSDC),包括NCBI 、EBI 和DDBJ 三大數(shù)據(jù)中心,形成領(lǐng)域內(nèi)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和共享使用的標(biāo)準(zhǔn),接收并存儲(chǔ)來(lái)自全世界科學(xué)家提交的組學(xué)數(shù)據(jù)。
在此背景下,為了推廣我國(guó)自己建立的數(shù)據(jù)庫(kù),GPB發(fā)表了一系列特色的數(shù)據(jù)庫(kù)文章。如在2017年第一期的封面文章介紹了基因組所大數(shù)據(jù)中心(現(xiàn)國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心)開發(fā)的組學(xué)原始數(shù)據(jù)存儲(chǔ)歸檔系統(tǒng)(GSA)。該平臺(tái)的目的是立足中國(guó),服務(wù)全球,收集、整合和歸檔國(guó)內(nèi)外用戶提交的原始序列數(shù)據(jù);目前GSA存儲(chǔ)的數(shù)據(jù)量已超過(guò)6.8PB。
同時(shí),GPB內(nèi)外兼修,也越來(lái)越注重封面設(shè)計(jì)。特別是從2018年起,該刊與專業(yè)設(shè)計(jì)團(tuán)隊(duì)合作推出了一系列中國(guó)風(fēng)濃郁的封面,將科技元素融入中國(guó)古畫,在給生物學(xué)知識(shí)注入藝術(shù)活力的同時(shí),傳播了中國(guó)文化。“學(xué)術(shù)期刊的封面不僅應(yīng)該是一幅最好的廣告,也應(yīng)該是一件最佳的藝術(shù)品。”于軍說(shuō),“創(chuàng)刊之初經(jīng)費(fèi)缺乏,我們的封面只能采用最簡(jiǎn)單的方式?,F(xiàn)在有了資源和能力,就一定要實(shí)現(xiàn)這個(gè)夢(mèng)。”
聚焦熱門和前瞻領(lǐng)域的發(fā)展趨勢(shì)出版專輯,也是GPB的一個(gè)特色。2012年至今,從微小RNA、誘導(dǎo)多能干細(xì)胞到精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和微生物組學(xué),GPB已出版了20多個(gè)專輯?!皩]嬐鶗?huì)邀請(qǐng)客座編輯主持,他們會(huì)向更多研究者介紹這本期刊,邀請(qǐng)大家投稿,增加期刊的影響力?!毙弦阏f(shuō)。
此外,GPB也一直致力于組織或參與專題性的學(xué)術(shù)會(huì)議,與科學(xué)家直接對(duì)話。如近日舉辦的GPB前沿研討會(huì)就聚焦單細(xì)胞組學(xué)和新冠病毒兩大主題,這也正是GPB即將推出的專輯的主題。這樣的形式受到參會(huì)者的積極評(píng)價(jià)。“期刊為推廣發(fā)表的工作所做的努力給我留下了深刻的印象?!鄙鲜鲅杏憰?huì)報(bào)告人及專輯作者、美國(guó)密歇根大學(xué)副教授Lana X Garmire說(shuō)。
“通過(guò)這類會(huì)議,我們希望邀請(qǐng)具有影響力的國(guó)內(nèi)外優(yōu)秀學(xué)者做學(xué)術(shù)報(bào)告,追蹤學(xué)科研究前沿,推動(dòng)我國(guó)基因組學(xué)研究的發(fā)展?!睏钸\(yùn)桂說(shuō)。
堅(jiān)守質(zhì)量謀新篇
2021年即將到來(lái),即將18歲的GPB正血?dú)夥絼?。它的下一個(gè)目標(biāo)會(huì)是什么?
于軍和團(tuán)隊(duì)的近期目標(biāo)是:繼續(xù)提高GPB發(fā)稿質(zhì)量,將小刊做強(qiáng);陸續(xù)增加發(fā)稿數(shù)量,將強(qiáng)刊做大;利用5年左右的時(shí)間,實(shí)現(xiàn)卓越,打造世界一流期刊。而長(zhǎng)期目標(biāo)則是推動(dòng)我國(guó)組學(xué)、生物信息學(xué)領(lǐng)域科學(xué)出版事業(yè)的長(zhǎng)遠(yuǎn)發(fā)展。
實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)并不容易。楊運(yùn)桂坦言,目前GPB優(yōu)質(zhì)的原創(chuàng)性稿件仍然偏少,且該刊面臨的是與全球期刊競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)質(zhì)的研究。
未來(lái)的三至五年將是GPB發(fā)展的“闖關(guān)期”。“做好了,會(huì)進(jìn)入國(guó)際一流;做不好,可能會(huì)曇花一現(xiàn)。”楊運(yùn)桂與同事們時(shí)刻保持著危機(jī)感。
這也讓他們充滿了干勁?!艾F(xiàn)在,我們要做的是提升雜志的投稿質(zhì)量和學(xué)術(shù)聲譽(yù),如果這些都上去了,實(shí)現(xiàn)月刊、提升影響因子將是水到渠成的事情?!毙弦阏f(shuō)。在他看來(lái),GPB有一群充滿熱情的編委和編輯,大家群策群力,一定會(huì)讓期刊進(jìn)入正循環(huán)。
從國(guó)內(nèi)整體環(huán)境看,于軍表示,建設(shè)一流期刊的優(yōu)劣勢(shì)并存。政策環(huán)境是有利的一面。例如,今年科技部、教育部出臺(tái)科研評(píng)價(jià)的新文件,要求對(duì)論文評(píng)價(jià)實(shí)行代表作制度,國(guó)內(nèi)科技期刊論文原則上應(yīng)不少于1/3?!斑@樣將會(huì)讓GPB擁有更多國(guó)內(nèi)的優(yōu)質(zhì)稿源。”
不利的一面是,當(dāng)前我國(guó)還缺乏促進(jìn)英文科技期刊蓬勃發(fā)展的完整出版產(chǎn)業(yè)鏈。比如:上游方面缺乏涵蓋國(guó)內(nèi)外期刊的大型文獻(xiàn)資源庫(kù),下游方面則缺乏專業(yè)的英文文字編輯和校對(duì)人員,亟需加強(qiáng)專業(yè)資源和人才隊(duì)伍建設(shè)。
“做一流期刊不是一朝一夕的事,也不是一件浪漫的事,其中要有很多深刻的思考,既有‘潤(rùn)物細(xì)無(wú)聲’式的細(xì)致性工作,也有‘西風(fēng)掃殘?jiān)啤降氖帨煨怨ぷ?,還可能遇到疾風(fēng)暴雨甚至是生死存亡的艱巨挑戰(zhàn)。過(guò)去走過(guò)的路告訴我們,無(wú)論如何必須要堅(jiān)持,堅(jiān)持就是勝利。只有勝利才是永恒的。”于軍說(shuō)。
期刊簡(jiǎn)介:
《基因組蛋白質(zhì)組與生物信息學(xué)》(GPB),是由中國(guó)科學(xué)院主管、中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所(國(guó)家生物信息中心)與中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)共同主辦、愛(ài)思唯爾和中國(guó)科技出版?zhèn)髅郊瘓F(tuán)有限公司聯(lián)合出版的開放獲取英文學(xué)術(shù)期刊,被SCIE等數(shù)據(jù)庫(kù)收錄。2020年度影響因子為7.051,位于期刊引用報(bào)告(JCR)“遺傳學(xué)與遺傳性”學(xué)科領(lǐng)域前10%。
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2018年第二期封面以明代絹本設(shè)色畫《絲路山水地圖》為藍(lán)本,將科學(xué)元素融入其中,RNA單鏈變身為蜿蜒交錯(cuò)的“道路”,RNA結(jié)合蛋白化為涌動(dòng)的“湖泊”,各種RNA表觀修飾為遠(yuǎn)近高低各不同的“城池”,上下求索的科學(xué)家則是策馬奔馳的“騎士”,生動(dòng)展現(xiàn)了RNA表觀調(diào)控研究中的探索精神和未來(lái)價(jià)值。GPB編輯部供圖
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2019年第二期封面出自于中國(guó)國(guó)寶級(jí)明朝巨作《出警圖》。美國(guó)耶魯大學(xué)的樊榮團(tuán)隊(duì)首次描繪了抗CD19嵌合抗原受體T細(xì)胞(CAR-T),細(xì)胞激活后在轉(zhuǎn)錄水平及細(xì)胞因子蛋白水平的單細(xì)胞功能圖譜,揭示了CAR-T超能力的秘密。手持大刀帶華蓋的將領(lǐng)表示擁有超能力的CAR-T細(xì)胞,他帶領(lǐng)其激活的免疫細(xì)胞和免疫反應(yīng)重要調(diào)控因子(士兵),共同攻擊癌細(xì)胞(城堡)。CAR-T將領(lǐng)不僅自己能夠沖鋒陷陣,更有能夠點(diǎn)石成金,賦予其他士兵戰(zhàn)斗能的神秘力量。GPB編輯部供圖
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