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不結(jié)球白菜俗稱青菜、小白菜，栽培面積由2005年的800萬(wàn)畝上升到現(xiàn)在的2100萬(wàn)畝左右，已成為第三大蔬菜作物。
近日，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院教授侯喜林團(tuán)隊(duì)在《園藝研究》在線發(fā)表研究論文。該團(tuán)隊(duì)經(jīng)過十多年深入研究，揭示了不結(jié)球白菜維生素C和硫代葡葡糖苷營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的代謝機(jī)制，為優(yōu)良性狀分子設(shè)計(jì)育種奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。
該研究以不結(jié)球白菜“蘇州青”為材料，利用最新的測(cè)序手段，獲得了396.83Mb近完整的高質(zhì)量染色體級(jí)基因組，并對(duì)其功能進(jìn)行注釋，其ContigN50為2.83Mb。此基因組質(zhì)量高于現(xiàn)有其他白菜基因組。
根據(jù)這一新基因組，研究發(fā)現(xiàn)重復(fù)序列占全基因組的比例約為53%，并且注釋得到了48,158個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因。比較基因組分析證實(shí)，不結(jié)球白菜經(jīng)歷了一個(gè)與其他十字花科物種共享的全基因組三倍化（WGT）事件，這發(fā)生在與擬南芥共享的WGD事件之后，為研究蕓薹屬蕓薹種亞種之間分化提供重要的依據(jù)。對(duì)維生素C和硫代葡萄糖苷（GSLs）合成和代謝途徑相關(guān)基因進(jìn)行了鑒定和比較分析，得到了串聯(lián)復(fù)制導(dǎo)致的基因拷貝數(shù)變異，并且GSL基因在白菜基因組中發(fā)生了高度擴(kuò)張。聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組分析，對(duì)相關(guān)基因的表達(dá)進(jìn)行了探究，揭示了不結(jié)球白菜維生素C和硫代葡葡糖苷營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的代謝調(diào)控機(jī)制
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